Les Pythium sont des oomycètes (règne des Chromistes) susceptibles de s'attaquer aux organes de nombreuses plantes cultivées en champ et en serre. Ils causent une grande variété de symptômes qui diffèrent selon l’espèce de Pythium, la température et le stade de développement des plants. Les plants affectés sont distribués en foyer, en rangée ou de manière éparse. Cette maladie est fréquente et sévère lors de saisons fraîches et humides ou pluvieuses. Elle évolue rapidement et peut causer des pertes économiques importantes.
La pourriture des racines et du collet est causée par différentes espèces de Pythium dont P. graminicola. Il peut affecter toutes les variétés de gazon, mais le gazon de saison fraîche (pâturin annuel, pâturin des prés, agrostide) l’est davantage. Il affecte également d’autres cultures dont les céréales (blé, orge), le haricot et le pois. Sur les terrains de golf, la pourriture des racines et du collet est généralement observée sur les verts et dans les allées. La pourriture des racines et du collet est généralement problématique tôt au printemps et à l'automne, lorsque la température du sol est fraîche (0 à 16 °C) et humide. Les dommages les plus évidents et les plus sévères surviennent lorsque la température est chaude et humide. Les verts situés à l’ombre et sur un sol humide montrent des plaques irrégulières, brun pâle à brun rougeâtre, et dégarnies de plants. Le gazon peut mourir en une journée.
Il hiverne principalement sous la forme d’oospores dans le sol ou sur les résidus de culture. Les oospores demeurent viables dans le sol plusieurs années. Au printemps, lorsque le sol est saturé en eau, les oospores germent et produisent des sporanges. Ces sporanges germent sur les tissus ou relâchent des zoospores biflagellées mobiles. Les sporanges sont dispersés par le vent et l’eau (pluie, irrigation par aspersion, éclaboussure) tandis que les zoospores sont attirées par des exsudats émis par les racines et nagent vers elles pour les envahir. Une fois à l’intérieur des racines, ils forment des oogones et accélèrent la dégradation des tissus. Les Pythium pénètrent les tissus directement ou par des blessures. La pourriture des racines et du collet est favorisée dans les sols très humides, peu ou mal drainés, trop irrigués, ayant un excès d’azote (N) ou une carence en calcium (Ca), un chaume épais et un taux élevé de matière organique. Les premiers foyers de contamination sont davantage observés dans les zones à haute circulation, qui reçoivent peu de lumière ou qui sont tondues trop courtes.
Les symptômes peuvent se manifester à tous les stades de développement de la plante.
Semence : pourriture humide de la semence avant l’émergence de la radicule, ce qui cause une réduction du nombre de plantules à émerger.
Plantule : fonte des semis en pré et postémergence. En préémergence, présence de lésions humides, brun foncé à noires, sur les plantules émergentes. En postémergence, présence de lésions humides, brun foncé à noires, sur les racines et qui progresse vers le collet puis à la base de la tige. Flétrissement, dessèchement puis mortalité des plantules.
Feuille : les feuilles affectées forment de petites taches diffuses jaunes de 4 à 8 cm de diamètre. Les symptômes sont plus importants à la périphérie des taches ou dans les endroits bien entretenus comme les verts et les allées. Les feuilles infectées sont plus étroites que les feuilles saines. Lorsque la température est humide, le gazon paraît foncé et visqueux et par temps sec, il paraît brun clair à brun rougeâtre. En se développant, les taches s’agrandissent, fusionnent pour former de grandes plaques irrégulières. Ces plaques suivent souvent le sens de l’écoulement de l’eau de surface (drainage). Finalement le gazon flétrit, brunit et meurt.
Tige : sur l’épiderme, présence de taches brunes aqueuses. Présence d’une pourriture humide dans la partie basale de la tige. Ramollissement de la tige à la hauteur ou juste au-dessus de la surface du sol.
Collet : paraît humide et avec des anomalies de coloration.
Racine : le système racinaire est faiblement développé, avec peu ou pas de racines latérales et de radicelles. Les racines sont blanc grisâtre à brunes et peuvent pourrir. Le cortex peut se séparer facilement de la stèle qui demeure intacte. Les radicelles et les racines latérales sont les portes d’entrée pour les Pythium. Notez que les racines infectées d’agrostide demeurent blanches et d’aspect sain.
Plant : le gazon croît lentement et paraît clairsemé. Flétrissement soudain ou non et mort rapide des plants affectés sans nécessairement montrer de jaunissement du feuillage.
Sur les plants, la pourriture des racines et du collet peut être confondue avec les symptômes causés par d’autres champignons du sol (Fusarium spp., Microdochium spp., Rhizoctonia solani, etc.) et des problèmes non parasitaires (excès d’engrais, excès d’eau, sécheresse, etc.).
Pour prévenir le développement de Pythium dans les sols, il faut utiliser des semences enrobées avec un fongicide si l’ensemencement se fait lors d’une période chaude et humide, privilégier les sols bien drainés et aérés, assurer une fertilisation équilibrée (surtout en azote (N) et en calcium (Ca)), éviter les baissières, les excès d’eau et l’irrigation en fin de journée. Favoriser la pénétration de la lumière dans le gazon et les mouvements d’air, augmenter la hauteur de coupe (tonte) et diminuer la fréquence de tonte.
Pour contrôler la maladie lorsque des symptômes sont présents, il faut maintenir une irrigation adéquate, réparer les plaques affectées lorsque possible, enlever les rognures, éviter de tondre et de se déplacer sur le terrain quand la maladie est présente et traiter avec des fongicides.
Smiley R. W., Dernoeden P. H. & Clarke B. B. (2005). Pythium Diseases. Dans Compendium of Turfgrass Diseases. 3è éd. APS Press, The American Phytopathological Society Press, St-Paul, Minnesota. p. 71-77.
http://www.otrf.ca/wp-content/uploads/2012/05/Use-as-Plant-Pathology-pythium-root-rot-Hsaing.pdf
https://ag.umass.edu/turf/fact-sheets/pythium-diseases-of-turf
http://ccenassau.org/resources/-turfgrass-pythium-blight-and-root-rot
http://slideplayer.com/slide/1630135/